Introducción: La estrategia diagnóstica de la fiebre de origen desconocido consiste en establecer un patrón de afectación orgánica que constituya una guía para el diagnóstico diferencial entre los diferentes grupos diagnósticos. Los marcadores de la inflamación constituyen una herramienta utilizada en la práctica clínica con dicha finalidad. Objetivo: Evaluar la utilidad diagnóstica de los marcadores inflamatorios en la fiebre de origen desconocido. Método: Investigación descriptiva y retrospectiva de 179 pacientes en los cuales se evaluó mediante la curva ROC la capacidad discriminativa de los marcadores inflamatorios. Resultados: Los pacientes del sexo masculino representaron el 54,2 %. Predominaron las enfermedades no infecciosas como categoría diagnóstica de la fiebre de origen desconocido. Los linfomas, la neoplasia de pulmón y la enfermedad de Still fueron los diagnósticos definitivos más frecuentes en esta categoría. El patrón de fiebre continua representó el 50,2 %. La enfermedad de Still constituyó el principal diagnóstico definitivo en pacientes con ferritina mayor de 1000 ng/ml. Los pacientes con eritrosedimentación mayor de 100 mm/h fueron diagnosticadosfundamentalmente con tuberculosis, linfomas y enfermedad de Still. Los marcadores inflamatorios evaluados no fueron útiles en este estudio para discriminar entre enfermedades infecciosas y no infecciosas. No fue posible identificar en este estudio un valor óptimo de los marcadores inflamatorios para diferenciar enfermedades infecciosas y no infecciosas. Conclusiones: Los marcadores de la inflamación evaluados de forma independiente en este estudio, no fueron de utilidad diagnóstica para discriminar entre enfermedades infecciosas y no infecciosas en pacientes con fiebre de origen desconocido.